Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPOLBQ9NRJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PAPOLBQ9NRJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms