Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SSU72Q9NP77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSU72Q9NP77 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms