Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAT1LQ9HCJ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VAT1LQ9HCJ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms