Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNRC6CQ9HCJ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNRC6CQ9HCJ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms