Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SEMA6AQ9H2E6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SEMA6AQ9H2E6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms