Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NBPF3Q9H094 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF3Q9H094 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms