Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12CQ9C0D7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12CQ9C0D7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms