Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CIPCQ9C0C6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIPCQ9C0C6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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