Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTNAP4Q9C0A0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNTNAP4Q9C0A0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms