Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSDMCQ9BYG8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GSDMCQ9BYG8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms