Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RTFDC1Q9BY42 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RTFDC1Q9BY42 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms