Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM2

DPCD, Protein DPCD, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPCDQ9BVM2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DPCDQ9BVM2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms