Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDFIP1Q9BT67 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms