Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLF1Q9BQI6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms