Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP88Q99567 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms