Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIGSQ96S52 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIGSQ96S52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms