Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS6KC1Q96S38 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS6KC1Q96S38 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms