Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNAQ96QF7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms