Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RNFT2Q96EX2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms