Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C18orf8Q96DM3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C18orf8Q96DM3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms