Protein–RNA interactions for Protein: Q96B42

TMEM18, Transmembrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM18Q96B42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM18Q96B42 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM18Q96B42 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms