Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCAMP4Q969E2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCAMP4Q969E2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms