Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GATAD2BQ8WXI9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms