Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
COPS9Q8WXC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
COPS9Q8WXC6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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