Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPF31Q8WWY3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPF31Q8WWY3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms