Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBG9

SYNPR, Synaptoporin, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPRQ8TBG9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNPRQ8TBG9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNPRQ8TBG9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms