Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF548Q8NEK5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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ZNF548Q8NEK5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF548Q8NEK5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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