Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPC24Q8NBT2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPC24Q8NBT2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms