Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PNLDC1Q8NA58 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PNLDC1Q8NA58 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms