Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD53Q8N9V6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms