Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSGALNACT2Q8N6G5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms