Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PDCL2Q8N4E4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDCL2Q8N4E4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms