Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG2Q8N3U4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG2Q8N3U4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms