Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLF2Q8IX21 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLF2Q8IX21 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms