Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC50Q8IVM0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC50Q8IVM0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms