Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIBP1Q86W92 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPFIBP1Q86W92 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms