Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA2D4Q7Z3S7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CACNA2D4Q7Z3S7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms