Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CYFIP1Q7L576 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CYFIP1Q7L576 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms