Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC80Q76M96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC80Q76M96 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms