Protein–RNA interactions for Protein: Q711Q0

C10orf71, Uncharacterized protein C10orf71, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf71Q711Q0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C10orf71Q711Q0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf71Q711Q0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf71Q711Q0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf71Q711Q0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf71Q711Q0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C10orf71Q711Q0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C10orf71Q711Q0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf71Q711Q0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf71Q711Q0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C10orf71Q711Q0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms