Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMBR1LQ6UX01 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMBR1LQ6UX01 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms