Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRSAM1Q6UWE0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms