Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms