Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC171Q6TFL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms