Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRRC8EQ6NSJ5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms