Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNS3Q68CZ2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNS3Q68CZ2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms