Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG87

PAPD7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD7Q5XG87 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PAPD7Q5XG87 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PAPD7Q5XG87 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms