Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf53Q5VUE5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C1orf53Q5VUE5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C1orf53Q5VUE5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms