Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf220Q5T0J3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C1orf220Q5T0J3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms