Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CEP78Q5JTW2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms